MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR64

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022603	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022603	AATTT	2	10	95	104	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022603	T	6	6	102	107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022603	GTA	2	6	108	113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022603	AAG	2	6	1568	1573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022603	AAG	2	6	1919	1924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022603	AGGG	2	8	2959	2966	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022603	AGG	2	6	4947	4952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_022603	AGGG	2	8	7987	7994	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022603	A	6	6	11396	11401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022603	AAT	2	6	11435	11440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022603	TAAA	2	8	11468	11475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022603	GATA	2	8	12128	12135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022603	ATT	2	6	12151	12156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022603	ATT	2	6	12161	12166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_022603	T	6	6	12209	12214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022603	ATAAA	2	10	12224	12233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022603	TAA	2	6	12306	12311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022603	AAGA	2	8	12355	12362	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_022603	GGT	2	6	15634	15639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022603	TA	3	6	15672	15677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022603	AGA	2	6	15684	15689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022603	A	6	6	15698	15703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022603	AAAAG	2	10	15705	15714	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022603	T	7	7	15989	15995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022603	ATT	2	6	16029	16034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022603	TAT	2	6	16046	16051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022603	AGG	2	6	16057	16062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022603	CTA	2	6	18278	18283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_022603	TAC	2	6	18297	18302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_022603	CCGGAG	2	12	18310	18321	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_022603	TTG	2	6	18333	18338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022603	TTC	2	6	18357	18362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_022603	ATT	2	6	18393	18398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022603	ATT	2	6	18424	18429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022603	A	6	6	18432	18437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022603	TAAG	2	8	18845	18852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022603	TCT	2	6	18902	18907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022603	TTTG	2	8	18959	18966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022603	AATT	2	8	18983	18990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022603	TAA	2	6	19010	19015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022603	ATC	2	6	19930	19935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_022603	CTTT	2	8	19936	19943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022603	AAGT	2	8	19948	19955	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022603	TAAA	2	8	19956	19963	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022603	AGT	2	6	19970	19975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022603	TG	3	6	20031	20036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022603	CA	3	6	20079	20084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_022603	GTG	2	6	20098	20103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022603	AAT	2	6	20180	20185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022603	T	7	7	20217	20223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022603	T	8	8	20232	20239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022603	A	7	7	20254	20260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022603	ATAG	2	8	20286	20293	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022603	AGA	2	6	20324	20329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022603	AGA	2	6	20341	20346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022603	AAT	2	6	20397	20402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022603	TAAG	2	8	21897	21904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022603	AAG	2	6	21941	21946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022603	TAAA	2	8	23087	23094	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022603	ATT	2	6	23096	23101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022603	TGA	2	6	23102	23107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022603	TTA	2	6	23120	23125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022603	ATT	2	6	23132	23137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022603	TGA	2	6	23226	23231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022603	TCT	2	6	23248	23253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_022603	AAT	2	6	23277	23282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022603	GTA	2	6	23329	23334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022603	A	6	6	23334	23339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022603	ATG	2	6	26972	26977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022603	ATT	2	6	27008	27013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022603	A	6	6	27030	27035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022603	ATT	2	6	27065	27070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022603	TAAAT	2	10	27098	27107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022603	T	7	7	27164	27170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022603	GAT	2	6	27171	27176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_022603	TCC	2	6	30831	30836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_022603	A	7	7	30910	30916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_022603	AAT	2	6	30932	30937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022603	TAT	2	6	31022	31027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022603	TTA	2	6	31147	31152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022603	AAT	2	6	31198	31203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022603	T	6	6	31205	31210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_022603	CTT	2	6	31222	31227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_022603	ATT	2	6	31270	31275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022603	AATT	2	8	31276	31283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022603	AGA	2	6	31287	31292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022603	AT	3	6	31347	31352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022603	TA	3	6	31355	31360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022603	A	8	8	31373	31380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_022603	TATT	2	8	32926	32933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022603	A	7	7	32979	32985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022603	TTCT	2	8	33638	33645	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_022603	TA	3	6	33648	33653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022603	AT	3	6	33659	33664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022603	TTAT	2	8	33665	33672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_022603	T	6	6	33686	33691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_022603	T	6	6	33793	33798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022603	TTA	2	6	33844	33849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022603	ATA	2	6	33853	33858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022603	TAAGT	2	10	33887	33896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022603	GT	3	6	33895	33900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022603	TTA	2	6	34925	34930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022603	A	7	7	34938	34944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022603	TA	3	6	34968	34973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_022603	ACA	2	6	34981	34986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_022603	TATT	2	8	34992	34999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_022603	A	7	7	35006	35012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022603	ATTA	2	8	35033	35040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_022603	AT	4	8	35073	35080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022603	TAT	2	6	35106	35111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022603	TAAA	2	8	35120	35127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022603	AGA	2	6	40255	40260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022603	AAATT	2	10	40289	40298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_022603	CTTA	2	8	40312	40319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_022603	TAG	2	6	40320	40325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_022603	TA	3	6	40359	40364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_022603	T	6	6	40468	40473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022603	GGA	2	6	40564	40569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_022603	A	7	7	41892	41898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_022603	CTC	2	6	42713	42718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_022603	AC	3	6	42735	42740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022603	GAA	2	6	42758	42763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022603	A	6	6	42771	42776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022603	ATT	2	6	42779	42784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022603	T	8	8	42795	42802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_022603	TAATA	2	10	42813	42822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022603	ATT	2	6	42842	42847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022603	TAA	2	6	43075	43080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022603	AAT	2	6	43094	43099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022603	ATAA	2	8	43169	43176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022603	A	6	6	43218	43223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022603	T	6	6	43246	43251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022603	T	6	6	43258	43263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022603	T	6	6	43280	43285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022603	CCT	2	6	44604	44609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_022603	CA	3	6	44689	44694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022603	ATT	2	6	44701	44706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022603	TTTA	2	8	44718	44725	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_022603	A	8	8	44787	44794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022603	AATG	2	8	44818	44825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022603	TA	3	6	44839	44844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022603	ATAC	2	8	44852	44859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_022603	GA	3	6	44891	44896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022603	GAA	2	6	44917	44922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022603	AAG	2	6	44932	44937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_022603	CCT	2	6	45672	45677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_022603	TAAAAA	2	12	45684	45695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022603	A	7	7	45691	45697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022603	AAT	2	6	45732	45737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_022603	TA	3	6	47101	47106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_022603	A	6	6	47124	47129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_022603	A	7	7	63311	63317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_022603	TAG	2	6	63541	63546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
298	NC_022603	TAT	2	6	63597	63602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_022603	A	7	7	63616	63622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_022603	AGA	2	6	63689	63694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_022603	ACT	2	6	63704	63709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
302	NC_022603	CAA	2	6	63723	63728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_022603	GTT	2	6	63753	63758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_022603	GAA	2	6	63789	63794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
305	NC_022603	A	7	7	63793	63799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_022603	AGT	2	6	63818	63823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
307	NC_022603	A	6	6	63905	63910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_022603	AAGA	2	8	63925	63932	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
309	NC_022603	ATG	2	6	63967	63972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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311	NC_022603	ATT	2	6	64054	64059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_022603	AAAG	2	8	64098	64105	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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319	NC_022603	CAA	2	6	64365	64370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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322	NC_022603	TATT	2	8	64401	64408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_022603	CAG	2	6	64416	64421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
324	NC_022603	GAA	2	6	64452	64457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
325	NC_022603	AAGAAA	2	12	64477	64488	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.